Az ultrahangos dopplerográfia diagnosztikai alkalmazásának legtöbb esetben transzkraniális dopplerográfiával együtt kell elvégezni. Kivételt képeznek ez alól azok a betegek, akiknek nem kellően kifejezett vagy teljesen hiányoznak az „időbeli” ablakok, valamint azok a betegek, akiknél a transzkraniális dopplerográfia más okokból nem lehetséges (a teljes vizsgálati alanyok 7-12%-a).