A HCV genomot egyszálú, pozitív töltésű RNS képviseli, amely 3 strukturális (nukleokapszid fehérjemag és az E1-E2 burok nukleoproteinjei) és 5 strukturális (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) fehérjét kódol. Ezen fehérjék mindegyikéhez antitestek (AT-k) szintetizálódnak, amelyek a vírusos hepatitis C-ben szenvedő betegek vérében találhatók.